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【2025年版】内部通報制度の導入マニュアル｜公益通報者保護法対応と実務フロー

2025/09/30

はじめに｜内部通報制度は「企業防衛の最後の砦」

内部通報制度は、従業員や取引先からの「不正・ハラスメント・法令違反」の早期発見に直結する仕組みです。
2022年に改正施行された 公益通報者保護法 では、従業員300名超の企業に制度整備が義務付けられました。

しかし、中小企業も「努力義務」とされていますが、実際には労基署・消費者庁の行政指導やSNS炎上、取引停止などの重大リスクを避けるためには、規模を問わず導入が欠かせません。

✅ 内部通報が「機能するか否か」で、炎上するか沈静化できるかが分かれます。

内部通報制度に求められる5つの要件（法的視点）

  1. 通報窓口の設置
    　内部（人事・総務）または外部（社労士・弁護士）。併用が望ましい。

  2. 通報者保護
    　公益通報者保護法により、不利益取扱い（解雇・降格・いじめ等）は禁止。

  3. 調査・是正措置
    　通報を受けたら迅速に調査チームを編成し、客観性を担保すること。

  4. 記録と保存
    　通報受付から調査・是正までの記録を残すことで、行政・裁判対応にも備えられる。

  5. 従業員への周知
    　「どこに通報すればいいか」「守られるのか」を周知しなければ機能しない。研修・社内掲示が必須。

内部通報制度の導入フロー（5ステップ）

① 方針策定

  • 通報対象範囲（例：法令違反・ハラスメント・労務違反・不正経理）を明確化

  • 社内規程に反映し、経営トップが責任を持つ姿勢を示す

② 窓口設計

  • 内部窓口：人事・法務・コンプライアンス部門

  • 外部窓口：社労士・弁護士など独立した第三者
    → 「社長直通で言えない」状況を防ぐため、外部窓口の導入が有効

③ 調査プロセスの確立

  • ヒアリング方法・調査記録フォーマットを定める

  • 第三者チェックを加え、恣意的判断を防止

④ 是正・再発防止

  • 規程改定・懲戒処分・再発防止研修を実施

  • 被害者保護と加害者の適切処分をバランス良く行う

⑤ 従業員周知・教育

  • ポスター・社内報・研修・eラーニングで全従業員に周知

  • 「匿名でも通報できる」「不利益はない」と明言して信頼性を高める

中小企業で多い失敗パターン

  • 社長直通の窓口しかなく機能しない

  • 通報しても握り潰される → 労基署・メディアに直行

  • 調査結果を開示しない → 従業員の不信感が増幅

  • 通報者を逆に処分 → 公益通報者保護法違反で裁判に発展

→ 外部窓口の設置が、不祥事の隠ぺい体質を防ぎ「企業防衛」につながります。

実際の事例（令和最新版）

  • 製造業A社
    　内部通報を放置 → 労基署に直接通報 → 是正勧告＋企業名公表

  • 医療法人B
    　パワハラを隠蔽 → 被害者がSNS投稿 → 報道炎上・患者離れ

  • サービス業C社
    　内部通報者を配置転換 → 公益通報者保護法違反で損害賠償請求 → 裁判で敗訴

よくある質問（FAQ）

Q1：従業員50名規模でも導入すべき？
A：努力義務ですが、ハラスメント・労務違反は規模を問わず発生。早期発見のため導入を推奨。

Q2：匿名通報には対応すべき？
A：匿名性がある方が通報は増えやすい。内容の信憑性は別途精査が必要。

Q3：外部窓口は必須？
A：法的に必須ではありませんが「社内では言えない声」を拾うために強く推奨。

Q4：調査は誰がやるべき？
A：社内チーム＋外部専門家（社労士・弁護士）で客観性を確保。

Q5：虚偽通報だった場合はどうなる？
 A：虚偽であっても不利益取扱いはNG。虚偽と判断した場合でも調査・記録を残し、通報者の権利を侵害しないよう留意が必要。

大企業と中小企業の違い（比較表）

項目 大企業 中小企業・零細企業
通報窓口 法務・コンプラ部＋外部弁護士 社長直通になりがち → 外部窓口が現実的
調査体制 独立した第三者委員会 社労士・弁護士のスポット調査で代替
周知方法 社内イントラ・eラーニング ポスター掲示・小規模研修
リスク 株価下落・株主代表訴訟 行政指導・SNS炎上・取引停止
再発防止 全社制度改定・監査部強化 マニュアル改訂・研修・理念共有

関連サービス（当事務所）

内部通報制度は「設置しただけ」では機能せず、通報者が安心して使える環境整備（外部窓口・周知・研修）がカギです。従業員が『安心して通報できる』と感じられる運用体制こそ本質です。

まとめ｜内部通報制度は「攻めのリスクマネジメント」

内部通報制度は「義務だから整備する」のではなく、
炎上・裁判・行政指導を未然に防ぐ「攻めのリスクマネジメント」です。

小さな声を早期に拾い上げられる仕組みが、従業員の安心と企業の信頼を守ります。

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参考リンク・ソース集（内部通報制度関係）